低分子肝素与肝素之间不能以单位换算的方式交替使用，不同的低分子肝素之间也不能以该种方式换算，因为各种制剂的制备不同，分子量分布不同，抗Ⅹa/Ⅱa的活性比不同，每种药物必须按其各自说明书使用。
肝素、低分子肝素不能用于肌肉注射。
肝素或者低分子肝素不能与非甾体消炎药联合使用，增加出血风险。
皮下注射：患者取卧位，注射部位为前外侧或后外侧腹壁的皮下细胞组织内，左右交替。注射针应垂直、完全插入注射者用拇指和食指捏起的皮肤皱褶内，而不是水平或者斜着注射，整个过程中应维持皮肤皱褶的存在。
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